Nuh tufanından başlarsak, tüm dünyanın yüzeyini kaplayacak kadar su nereden geldi? Nereye gitti? Nuh nasıl olup da dünyanın dört bir yanından milyonlarca, ki çoğunluğu halen keşfedilip sınıflandırılmamış canlıları topladı? Bu canlılar ne yedi? Neyle beslendi? Hem o milyonlarca canlı türünü, hem de onları besleyecek yiyeceği sığdırabileceği sığdırabileceği bir gemiyi nasıl inşa etti? Kaldı ki canlı türlerinin çoğunluğu böcek ve mikroskobik türlerdir, Nuh tüm dünyayı gezmiş, böcek peşinde koşmuş, bakteri mi toplamış? Teknolojimiz bu kadar ilerlemişken bile bunu yapmak mümkün değildir. Sadece belli endemik türlerle beslenen canlılar var, bu yiyecek kaynağını nasıl barındırmış? Birbirinin zıttı ekstrem koşullarda yaşayabilen canlıları nasıl aynı yerde yaşatabilmiş? Hadi hepsini yaptı diyelim, nerden geldiği belli olmayan sular da puff diye yok olmuş olsun, tüm dünyayı basmış bir selin tek bir izi belirtisi nasıl olur da olmaz? Nuh tufanı bilimsel olarak tamamen imkansızdır, mantık hatalarıyla doludur. Tek açıklaması "Allah'ın mucizesi" şeklinde olabilir, bu da bilim falan değildir.

Kuran'da ilk insan olarak Adem'den bahseder. Bilimsel olarak biliyoruz ki ilk insan diye bir şey olamaz. Mikroskobik düzeyde "canlılık" olarak adlandırabileceğimiz zamandan bu zamana istisnasız her canlı kesintisiz bir sürekliliğin içindedir, ilk insan, ilk kuş, ilk böcek, ilk bilmemne diye bir şey yoktur. ilk insandan bahsetmek taban tabana evrime zıttır.

Evrenin başlangıcı hakkında "kesin" bir bilgimiz yok. Büyük ölçüde tahminlerimiz var, üstüne üstlük "6 gün" ibaresi evrenin nasıl başladığına değil, başladıktan sonra nelerin olduğuna değinir. Sanırım Kur'an'da bahsedilmiyor, ama Tevrat'ta detaylı olarak ilk günde şu, ikinci günde bu yaratıldı şeklinde açıklamalar vardır. Kur'an da sadece "6 gün" kısmını almış.