2006 Dünya Kupası'na ise yine Totti damgasını vurdu. Kupayı italya dramatik bir sonla Fransa'nın elinden alırken Fransesco muhteşem kariyerine bir de dünya kupası şampiyonluğu ekliyordu.

Dünya Kupası’nın ardındaki sezona da damgasını vuran Totti, 26 golle kariyerinde ilk kez gol kralı oluyordu. 30 yaşında elde ettiği bu krallık ve kazandığı altın ayakkabı, kendisi hakkında “Acaba kariyeri düşüşe geçecek mi” diye düşününlere tokat niteliğindeydi.Ve bu ne ilk,ne de son olmuştu.

Totti'nin son yıllardaki performansına bakacak olursak, şüphesiz en unutulmaz an geçen sezonki 3-2 biten Lazio maçıdır. Roma 2-1 gerideyken ikinci yarıda oyuna Totti giriyordu. Roma Olimpiyat her zamanki gibi yıkılıyordu.63.dakikada Totti çok güzel bir golle skoru eşitledi ve çok sevdiği kale arkası tribünübe koştu. Kenardaki görevlilerden bir telefon alarak taraftarlarla yaptığı selfie en unutulmaz anlardan biriydi. Ayrıca Totti ilerleyen dakikalarda Roma'nın 3. golünün asistini de yaptı.
Bu sezon ise maalesef geçen sezonki gibi az forma şansı buluyor. Ancak UEFA Avrupa Ligi'nde 6 maçta 288 dakika süre alan Totti 4 maçta yaptığı 4 asistle takımının gruptan çıkmasında en önemli rolü oynadı. italya Kupası'nda ise 90+7 de attığı gol ile takımını yarı finale taşıdı ve bizleri yine kendine hayran bıraktı.Bu sezon ligde ise 10 maç 2 gol 2 asistle oynayan Totti bu yaşında aldığı her dakikada takımına en iyi şekilde katkı yapıyor.

Totti'nin kariyerindeki önemli anlar ve başarılar bunlar. Ayrıca FIFA 100 olarak bilinen Yaşayan En iyi 125 futbolcu listesinde bulunmaktadır. Genel olarak toparlarsak büyük kaptanın en önemli kariyer başarıları Mayıs 2016 tarihli istatistiklere göre şöyle:
2 kez Serie A Yılın Futbolcusu, 5 kez Yılın italyanFutbolcusu seçilmiştir. 605 Maç 250 Gol ile Serie A tarihinde en çok gol atan 2. futbolcudur. Totti 2006-2007 sezonunda attığı 26 golle italya Serie A gol kralı olmuş ve Avrupa Altın Ayakkabı (European Golden Shoe) ödülünü kazanmıştır. Şampiyonlar Ligi, UEFA Ve italya Kupa