El caudillo (lider) sıfatıyla ispanyol devletine Falanj’ın siyasal ilkelerinden esinlenerek otoriter bir yapı kurdu. Ordu, kilise ve büyük toprak sahiplerinin desteğiyle her türlü muhalefeti susturdu. Ayrıca Bask bölgesinde ve Katalonya’da bölgesel özerkliğe tümüyle son verdi.Çünkü ispanya’ya bağlı bu iki ayrılıkçı bölgenin özerk statüleri devam ettiği takdirde o bölgelerin halkları olan Bask ve Katalanlar’ın bu gevşek yapıdan yararlanarak gerekli olgunluğa ulaşır ulaşmaz ispanya’dan ayrılacaklarını ve bağımsız olacaklarını, bunun da ispanya’nın parçalanması demek olduğunu iyi bilen Franco, benzer nedenlerle ülke genelinde ispanyolca dışında Baskça ve Katalanca gibi dillerin konuşulmasını da yasaklamıştır. Etnik anlamlar taşıyan tüm bölgesel isimler (Katalonya ve Bask gibi) ispanya’nın toprak bütünlüğüne aykırı bulunarak resmi kullanımdan çıkarıldı ve ispanya’da üniter sayılabilecek güçlü bir merkezi yönetim oluşturuldu. iç savaş döneminde olduğu gibi Franco’nun güçlü olduğu dönemlerde de bazı ayrılıkçı Bask ayaklanmaları olmuş; ancak her defasında bu isyanlar Franco’nun askerleri tarafından sert bir şekilde bastırılmıştır. Ayrıca Franco iç savaşta burjuvadan ve kiliseden de büyük destek almıştır.