Öncelikle bir şeyin kanıtlanabilmesi için gözlemlenebilir olması gerekmez. Bir çok doğrudan gözlemlenemeyen şey bilimin imkanları sayesinde kanıtlanabilir. Ancak evrim bunlardan değil. Evet geçmişe dair bir çok şeyi doğrudan gözlemleyemiyoruz bugün. Ancak basit evrimsel değişimleri görüyoruz. En basitinden grip virüsü sürekli olarak evrim geçiriyor. Beta balıklarının labirent organını geliştirmesi (daha doğrusu sadece geliştirebilenlerin hayatta kalması) evrimin bir örneğidir Ha yeni bir türün oluşması çok uzun zaman alan bir süreçtir. Bunu gözlemleyemeyiz ancak çevremize baktığımızda gördüğümüz her canlı yeni bir türün oluşum sürecindeki bir halkadır aslında.

Tür oluşum sürecini doğrudan göremesek de fosiller yardımıyla görebiliyoruz. Ancak burada da başka bir sorun karşımıza çıkıyor. Fosil oluşumu oldukça sıkıntılı bir süreç. Zaten öyle olmasa dünyamız fosillerden geçilmez bir yer olurdu :D Buna karşın biz sınırlı fosillerle bir çok canlının(ekgibler olsa da) evrimsel soy ağacını çıkarabiliyoruz. Bunları bilimin bize sunduğu bir çok yöntem ile bilimsel temele oturtuyoruz.